Bozüyükspor,Bozüyük İdmanyurdu adı altında 1926 yılında kuruldu ve bir yıl sonra katıldığı futbol sezonunda Ankara'da yapılan Anadolu Kupası'na iştirak etti. Başarılı olan Bozüyük İdmanyurdu,ikinci olarak ilçeye kupayı getirdi. 1933-34 sezonunda Eskişehir bölgesinde yapılan lig maçlarına katılan Bozüyük İdmanyurdu,Türkgücü,Demirspor,Gençlerbirliği gibi takımların bulunduğu ligde yine ikinci olarak başarısını sürdürdü.1946 yılında ise kulüp isim değişikliği yaşadı.Beden Terbiyesi Genel Müdürlüğü'nün talimatları ile Bozüyük Gençlik adını alan kulüp, bölge şampiyonluğunu kimseye bırakmayarak dışarıda ve içeride başarı ile faaliyetlerini sürdürdü.

1973 yılında Bozüyük futbolda daha canlılık yaşamaya başladı.Bu canlılık kulübe de yansıdı ve büyük atılımlar gerçekleştirebilmek için Sümerspor,Yıldırımspor,Azimspor kulüpleri ile birleşerek bugünkü Bozüyükspor adını aldı. Armasında bulunan dört yıldız buradan gelmektedir.1926 yılında siyah beyaz forma renkleri ile maçlarına çıkan Bozüyükspor,1973 yılında bugünkü forma rengi olan lacivert beyaz renkleri taşımaya başladı.Bozüyükspor profesyonel lige ilk adımını 1986-87 sezonunda 3.Lig'e girerek attı.1 990-91 sezonunda büyük bir başarı elde ederek 2.Lig'e çıkmayı başardı. 1990-91 sezonunda 1 yıl süre ile 2.Lig'de oynayan Bozüyükspor kalıcı olamadı. Önce 3.Lig'e sonra amatör kümeye düşen Bozüyükspor, uzun yıllar amatör kümede final oynamasına rağmen bir türlü 3.Lig biletini alamadı.
Nihayet uzun bir aradan sonra Bozüyükspor 2005-2006 sezonunda yarı finallerde Vefa yı ve final maçında da İzmit Körfez Belediyespor'u yenerek yeniden 3.Lig'e çıktı.
2006-2007 sezonunda 3.Lig'de bir ilki başaran Bozüyükspor ligin 2.haftasında aldığı liderliği bütün sezon taşıyarak ligin bitimine 4 hafta kala 2.lige çıkmayı garantiliyor ve sezon sonu itibariyle de 63 puanla Afyon'un 6 puan önünde şampiyonluk ipini göğüslüyordu.

Yönetim, Tesisler, Sponsorlar